Yearly Archives: 2010

今天去了世博园

各个馆还是很漂亮,只是人多。昨天本想创新高(9.23达63万之多)结果才25万,今天刚才看了一下统计,已经有38万。多数排队都很长,只是从馆前看看,照个照片就过来了。只是看了几个小馆,排队在半小时以内。真要认真看,估计需要一周,内容还是很丰富。一个感受是中国馆真是很气派,占了偌大的地盘;美国馆英国馆等头号资本国家相对比就寒碜多了。罗马尼亚馆说为了公平,不设绿色通道,有点讽刺哦。园内喝了可乐,吃了吉野家,价格都可以接受,没有传说中的很贵。插队推挤到处可见。罕见的老外们还是高人一等。志愿者跟人讲话,都是不看人,感觉没有礼貌,不过是通病了。

世博参观人数达7000万按官方数据应该没有问题,只是很好奇,里面有多少是外国人,不知道官方能否给出个各国参观人数的统计。否则所谓刺激经济也是将全国人的钱转到上海钱袋里。至少今天匆忙转了A、B、C、E区,个人感觉99.9%是国人。

回到宾馆,感觉腰酸腿痛。

GIS方法理论2010年会

上海同济,很多人是冲着世博来的。共2天,一天半是专家报道,不分分会场,是一些国内知名专家的报告。地信的领域有些杂,所以国外的高校一般不专门开地信的系,而是将地信作为一些专业的基础课。其实一些专家的报告并不感兴趣,但没得选择。第2天半天,分了若干个分会场,集中了几十个非知名专家的报告,包括我的。里面有一些感兴趣的,由于同济的这种安排法,也听不成。

这个年会也越来越变成知名专家们的年度聚会了,并没有多少时间听到青年科学家的声音。知名专家里,除了一些有原创性,也有不少是跟随大流的成果,随便吹吹牛自己团队有多少的经费和项目。Google太可恨了,出了个google earth/map,叫多少个gis专家脸面无光了。

有个叫吴志强的同济教授,是上海expo 2010总规划师,讲了一个生态世博的主题,讲话能力十分强,而且政治绝对正确。坐在我边上的学生们个个听的入神一直鼓掌叫好,吴教授争了中国人的光。象我等因为在国外呆了一些时间,有时候感觉很不以为然,对一些观点甚至看出不同的结论,不过没有这个讲话的本事,即使给争的机会也不知道如何争辩,注定了国内平庸的生活。

在超算上执行Matlab程序

新发展了一个算法,对MODIS LST进行重建。对象是青藏高原250sq km,共2.7M多个点。工作量十分大。写了Matlab代码。在实验室工作站进行 parallel运行,开了8个labs,每一幅大约花费 3-5小时。希望计算2005年一年的day和night LST。计算时间不能接受。

研究所部署有曙光5000大型机。LSF管理系统。在个人用户下(不一定需要系统权限,一般用户即可)安装了Matlab 2010a,MatlabRoot是 /public1/CAS/wanglx/matlab1。Putty连接到超算后,执行./matlab1/bin/matlab,提示glibc 不支持,当前版本是 glibc 2.4,2010a支持的版本是 2.7,需要用户输入y 才能继续进入到matlab。需要对oscheck.sh进行crack,否则以后的bsub提交系统会有问题。vi $Matlabroot/bin/util/oscheck.sh进去后,注释掉584行 read ans(前面添加 #)。其后插入一行 ans = ‘y’。:w! 保存(加!是因为文件是只读),:q退出 vi。

安装XME,远程连接到超算,启动matlab,在Parallel菜单里配置 default configuration。配置一个合适的叫lsfconfig。设为default。注意在字符界面下是无法配置 defaultParallelConfig的。

使用parallel configuration是为了使用matlabpool 进行自动的分割和管理。否则自己得使用设定scheduler, job, 和task 还得自己管理输入和输出。比较麻烦一些。matlabpool 可以跟 parfor等连接起来使用,对于我们面临的任务简单的for循环十分适用。

退出xme。以 matlab -nodisplay进去,调用 interp_lst2 执行,以high 队列进去,自动连接到 256个labs进行计算。在configuration时配置 submitarguments 为 -qhigh。

interp_lst2的结构如下:

function interp_lst2

%set up some variables and reading data in from files

matlabpool open lsfconfig 64

for i=1:length(lst_data_fns)

decompose2_func(interp_image_fn, lst_dir, ref_dir, output_dir, …
dem, slope, aspect);

end

matlabpool close

function decompose2_func(…)

%set up variables

parfor i=1:interp_count

end

%posterior procedures

Putty连接Linux 如何后台运行

Putty连接后运行一个Linux程序,如果关闭Putty session,程序也将退出。解决方法是使用Screen。

Putty连接成功好。在命令符运行screen,启动之。

在screen窗口里执行程序,Ctrl-a d将此窗口 与Putty会话断开。此时将 Putty关闭,程序仍在远程Linux机器上运行。

下次Putty连接进去后,运行 screen –ls 列出全部的screen会话,找到对应的id号。

screen –r <id>恢复到上一会话。

黑河土壤调查

与南师大的李硕老师出了一趟野外,主要是黑河流域中上游的土壤调查。调查内容包括环刀取样和原状土的渗透系数测定。前后十天。

调查点地图如下,基本是将中上游的主要土壤和土地利用类型控制住了。这应该是近些年来黑河流域开展最为系统的一次调查了。

map 
三角为调查点,红色区域为黑河流域上流,紫色为中游区域。

DSC_0669 
分两小组分别工作,我们小组在达坂山垭口的合影

An IEEE paper

[1] Nan Z, Wang S, Liang X, et al. Analysis of spatial similarities between NEXRAD Stage III and LDAS Combo precipitation data products[J]. IEEE Journal of Selected Topics in Applied Earth Observations and Remote Sensing. 2010, 3(3): 371—385. DOI:10.1109/JSTARS.2010.2048418.

下载

A paper

[1] Chen H, Nan Z, Zhao Y. Water-saving city evaluation system based on knowledge inference[J]. Journal of Glaciology and Geocryology. 2010, 32(4): 731—739.[陈昊,南卓铜,赵彦博. 基于知识推理的节水型城市评估系统[J]. 冰川冻土. 2010, 32(4): 731—739.]

下载

 

出野外

出来野外已经是第三天。今天住在祁连山里的野牛沟乡里。这里连联通的信号都没有。

不过很意外,电信3G信号很好。估计是用了移动的网络。

第一天从兰州到张掖。第二天从张掖到民乐,沿途分两个车分两个小组(一组李硕带队,一组我带队)做了6个土壤剖面,内容包括环刀采样,称重,饱和下渗导水率。今天(第三天)从民乐经扁都口、祁连到野牛沟,两小组完成了7个剖面。工作很辛苦,上午6点半起床,晚上9点才吃完晚饭。还要将本子上的记录整理到笔记本电脑上。但工作开展的很顺利。工作将持续8-10天,采集剖面达45个左右。

李硕老师讲,黑河流域这样大规模的土壤采样,是没有前例的。已有的土壤剖面都集中在张掖附近。我们的工作将极大改进流域的土壤资料。

参加工作的南师大学生、寒旱所学生表现的都十分优秀。谢谢大家。

孤儿学校小朋友参观世博

上海慈善基金会资助一些小孩去看世博。今天(8.14)他们踏上了去上海的火车。包括化旦师傅、2个老师、17个孤儿学校的小朋友,2个舟曲灾区来的小朋友,和一个兰州晨报的随行记者。当然还有过来兰州接的蓓茹。火车票紧张,坐的硬座。蓓茹讲,这是她第一次坐的硬座。辛苦了。

人民网的张记发了稿件,写的不错。也要感谢徐珂及他的同事。谢谢大家的一片爱心。

很多小朋友是第一次走出小山村。这次活动也许可以改变他们中一些人的一辈子,让他们知道外面的世界跟自己处的地方不一样,有值得自己去努力争取的东西。人一旦有了前进动力,一辈子就会不一样,尤其是小朋友。除了作秀,从这一意义上讲,也许还有些用。

A类所的尴尬

甘南舟曲泥石流造成重大人员伤亡和财产损失。政府和社会力量各施其职各尽其力,为救灾作了最大努力。灾难让人痛心,爱心让人感动。作为中科院在甘肃的一名科研人员,我其实很希望看到中科院驻兰的研究所在其中发挥作用。汶川玉树都看到北京一些中科院研究所做了大量工作,拍摄了灾后航拍照片,重建意见等等,体现了作为国立研究所的应有责任。发生在甘肃省内的舟曲重大环境灾害,却好像跟中科院驻兰A类所没有关系。除了例行捐款,A类国立研究所好像还能做些什么吧,何况A类所本来就是做环境生态领域的。

上次在乌市看到新疆分院领导坐骑挂新蛋牌,便感受到他们院地关系的融洽。甘肃的中科院单位这么清高,整天只想解决基础科学难题,不屑关注实际问题比如环境灾害,好像也不好吧。若干年前A类所还有泥石流研究室,后来给撤了。我前面就在琢磨,难道西北没有灾害问题了?难道成都一家做灾害的研究所除了西南的,连西北的也做完了。撤室无非几个原因,没人或者没钱,或者领导不重视。人是肯定会有的,领导也是很重视的,所以估计是申请不到做灾害的经费。西北可能灾害就小打小玩,不值得研究吧。不过经过舟曲这次,估计没人这么想了。想到一句话,很残酷,叫社会的丁点进展,都是用鲜血推动的。大抵如此。

舟曲灾难太过骇人,其实近期甘南其他地方也相继发生泥石流等灾难事件,都有发生人员伤亡,往年也有,只是没有今年典型。西北绝不是没有灾害,或者不值得研究。兰州的A类研究所除了解决科学问题,也要关心、思考和解决当地实际存在的各种问题。